產(chǎn)品介紹
全外顯子組測(cè)序(Whole Exome Sequencing,WES)是利用探針雜交富集蛋白編碼區(qū)域DNA序列,通過高通量測(cè)序,發(fā)現(xiàn)與蛋白質(zhì)功能變異相關(guān)的遺傳突變。研究顯示:人類全外顯子組只占人類全基因組長(zhǎng)度的1%左右,由DNA變異引起的疾病大致有80%以上來自于外顯子組區(qū)域的變異,因此全外顯子測(cè)序遠(yuǎn)比全基因組測(cè)序(Whole Genome Sequencing,WGS)更簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì)、,其目標(biāo)區(qū)域覆蓋度也更高,便于變異檢測(cè)。
檢測(cè)流程
1、樣本采集,提取基因組DNA。
2、將基因組DNA打斷,構(gòu)建隨機(jī)片段文庫(kù)。
3、文庫(kù)純化,然后通過外顯子捕獲系統(tǒng)進(jìn)行雜交富集。
4、PCR擴(kuò)增,qPCR質(zhì)量檢測(cè)。
5、上機(jī)進(jìn)行高通量測(cè)序。
6、數(shù)據(jù)分析。
信息分析流程
信息分析內(nèi)容
1、去除接頭污染和低質(zhì)量數(shù)據(jù)。
2、進(jìn)行數(shù)據(jù)產(chǎn)量統(tǒng)計(jì)分析、測(cè)序深度分析、覆蓋度均一性分析。
3、SNP、Indel變異信息檢測(cè)。
4、SNP、indel的RefGene注釋。
5、SNP、Indel數(shù)據(jù)庫(kù)分析 (與dbSNP、千人基因組數(shù)據(jù)、ESP外顯子組數(shù)據(jù)庫(kù)、炎黃基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)注釋分析) 。
6、單樣品SNP保守性預(yù)測(cè)、致病性分析 (SIFT、Polyphen-2、Phylop、GERP scores)。
7、SNP、InDel在各基因功能元件上的分布統(tǒng)計(jì)。
樣本要求
1、基因組DNA:Illumina:DNA濃度≥20 ng/μl,總量≥6 μg,OD 260/280介于1.8-2.0之間,電泳檢測(cè)無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰、完整。樣品濃度越高越好。
2、血液樣品:請(qǐng)使用專業(yè)抗凝管儲(chǔ)存樣品。哺乳動(dòng)物血液提供>2ml,有細(xì)胞核的血液>500ul。
3、樣品中有多糖、糖蛋白的殘留,往往對(duì)打斷DNA樣品帶來非常大的麻煩,且很難去除,因此特別要求,客戶提供的樣品一定要將多糖或糖蛋白去除干凈。
4、樣品保存期間切忌反復(fù)凍融。
服務(wù)流程
1、提交項(xiàng)目課題相關(guān)需求和資料。
2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)討論項(xiàng)目細(xì)節(jié)。
3、根據(jù)討論后的意見對(duì)實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行修改。
4、雙方均滿意并達(dá)成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
5、開展實(shí)驗(yàn),按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。
6、結(jié)題,提供實(shí)驗(yàn)原始結(jié)果和分析結(jié)果、實(shí)驗(yàn)流程、實(shí)驗(yàn)條件等等。
我們的優(yōu)勢(shì)
1、適用于單細(xì)胞、微量細(xì)胞樣品。
2、數(shù)據(jù)質(zhì)量高、偏差小、高度均一。
3、高通量,單個(gè)樣本可達(dá)30-100X的測(cè)序深度和數(shù)據(jù)產(chǎn)出量。
4、*的覆蓋度,能檢測(cè)到90%以上的SNP位點(diǎn)信息。
5、檢測(cè)靈敏度和準(zhǔn)確度高。
6、能夠全面發(fā)掘新的和稀有的遺傳變異
咨詢與訂購(gòu)
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